Проблема при удалении субдоменов и cpanel. Субдомены не удаляются, в ответ выводится сообщение:
Error from domain wrapper: subdomain 'sub.domain.com' does not exist for user 'user'
Из WHM тоже субдомен не удаляется, как и из клиентской cPanel.
Как решилось:
Удаляем нужный субдомен из
/etc/userdomains
и запускаем
/scripts/updateuserdomains
